雙孢菇培養料在發酵過程中，由于措施不當，所屬條件得不到滿足時，往往容易產生下列問題：

(1) 厭氧發酵堆溫不高

糞多、草少，料堆壓得過緊，造成透氣不良，厭氧發酵堆溫不高。要及時采取措施，提早翻堆，將培養料拌松，縮小料堆，增加通氣性，以提高堆溫。

(2)水分太少

草多、糞少，堆得太松，垛太小，經風吹日曬，料內水分蒸發，糞草過干，微生物活動困難，堆溫不高。在這種情況下，也應提早翻堆，將料堆適當放寬，適當拍緊，加足水分，以利于升高堆溫。

(3)培養料發黑、發黏、發臭或發酸

翻堆時發現部分培養料發黑、發黏、發臭或發酸，這主要是由于培養料內水分過多，造成厭氧發酵的結果。在翻堆時將中間黑、黏、臭、酸的培養料翻到外面，將料抖松，散發水分，在料堆內打洞，增加透氣性。

(4)放線菌容易大量繁殖

料堆內產生白色粉末狀物質，在高溫、干燥的情況下，耐高溫的放線菌容易大量繁殖、生長，消耗培養料的養分。發現有白色粉末狀物質的部位，必須澆足水分，防止高溫區過干。

(5)料堆內草腐爛，糞塊生，有氨氣

產生這種情況的原因，主要是培養料前期堆溫不高，又沒有及時采取適當措施，使培養料不是腐熟而是腐爛，需及時翻堆，提高堆溫。

(6)后發酵結束培養料過干

主要原因是前發酵結束后，培養料含水量未適當提高，后發酵期間又未能采取保濕措施。播種前雖又補水，但易引起雜菌的感染，此時可用消毒液、多菌靈溶液調節水分，既補充了水分，又可防止雜菌的發生。

(7)鬼傘

鬼傘孢子大量存在于糞堆和霉變的稻草、麥稈上，在高溫、高濕和堿性環境特別是培養基有較多氨氣存在時極易發生。

鬼傘在子實體發生前，菌床上沒有明顯的特征。一旦子實體形成，則可看到許多灰白色或黑色的小型傘菌，散生或簇生。

防止鬼傘發生應從培養料堆制入手，將畜糞、稻草、麥稈曬干，特別是已霉變的麥稈應曬干，殺死鬼傘孢子。選用適當的培養基組成，防止高氮含量。

室外前發酵時若發現料堆周圍有鬼傘，將其翻入堆中心，讓高溫殺死菌絲和孢子。室內后發酵時溫度應逐漸上升，并適當通風換氣，供應充足的氧氣，以免產生厭氣發酵，使料內氨氣充分散發，提早覆土能抑制鬼傘的生長。