銀耳栽培管理可分為菌絲生長，子實體形成、子實體發育及擔孢子形成四個階段。在各個階段，銀耳的生長特點和對環境條件的要求有所差別，管理上應采取相應的措施。
按種后1—12天為菌絲生長階段。其中1-4天為發菌期，需要氧氣較少，可采取密封培養的辦法，保持接種口密封，并置于干燥的菌絲繁殖室進行培養，以防止雜菌進入接種口。
過6天后，室內要進行微量通風，以適應菌絲生長。
接種后13～20天為子實體形成階段，需要較多的氧氣，較高的溫度和較強的光照，此階段可敞開培養，把瓶口的薄膜拿掉，換上能透氣的牛皮紙套筒；
袋栽的可將接種口上的膠布掀開一小角，讓新鮮空氣進入菌絲體內，并把它移放于多濕的予實體分化室內培養。
接種后21-40天為子實體發育階段，此階段要求有充足的濕度，氧氣和光照，以促進耳片健壯伸展。
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