七、滅菌
拌料時因為已加低溫滅菌劑，在5小時內菌袋內部溫度要上升到100℃，控中間是將100℃保持28-30小時，同時密切觀察鍋內水位，防止鍋內燒干。
滅菌時間結束，停火后應打開灶門通氣30分鐘，套上棉紗手套，取出黑木耳的菌袋，同時仔細檢查菌袋，如發現有小孔殘破袋，立即用膠布封貼，以防雜菌侵入造成感染，菌袋要及時搬到巳消毒好的接菌室疊好，讓其自然冷卻。
八、接種
消毒30分鐘后開始接種黑木耳，接種最好用熱風接種器，要求菌絲粗壯潔白，菌種適齡，一般栽培種是用塑料袋裝的菌種，接種時用75％酒精，棉球擦凈表面消毒，接種要注意以下4點：
(1)傳袋人發現袋面有雜物要用干布擦凈；
(2)打筒人左手拿75％酒精，棉球消毒袋面，接著右手拿制穴工具；
(3)接種時速度要快，菌種要高于袋面2mm，以防空氣侵入，然后再用17x 50cm規格塑料袋套栽培袋；
(4)種袋疊成井型，要求疊放整齊、有序，留有間隔，疊得太緊太高，不利于通氣。
九、黑木耳栽培養菌
如果在大棚內養菌，棚外蓋二層簾子，棚內砌煙道就可以。菌袋裝在食品袋后吊袋，初期棚內溫度保持在25度以上有利于菌種快速萌發。菌種發后半月左右開始棚內溫度必須控制在23度以下，最佳溫度為18-20度。
十、割口
當菌袋已布滿潔白的菌絲合理成熟時，即可開孔。選擇陽天氣候，用刮胡須刀片割口，割成“v”形，直徑2厘米，可防止噴水進入袋內，引起污染，一袋一般割12—15刀口，穴與穴之間呈梅花型錯開。
十一、黑木耳掛袋和澆水管理
每100平方米大棚掛菌袋1萬袋左右為宜。采用平袋二線吊法，春季和秋季一般白天澆水，其余時間大通風，高溫天氣和伏天一般晚上澆水，其余時間，每天澆15次左右，開頭澆水時間較長一些，其余每次澆水3分鐘左右就可以。一般澆水10天左右，木耳即可長成。
十二、黑木耳采收管理
當黑木耳子實體長到八成熟時，耳片充分展開。應及時采收，采耳時一手拿袋一手將耳順袋采下，注意不要將耳根留在袋內，防止耳基受雜菌感染影響出耳，采下的耳要剪去帶培養基的耳根，大朵撕開分類，成為單片耳，質優價高。
