1、對動物健康的影響：迄今為止還未發現雞糞飼料對牛的健康有任何的不良影響，但曾發現用含銅量高的雞糞飼喂母羊時出現過中毒現象，但只要控制日糧的含銅量不超過50毫克/千克，對羊只的健康就不會有影響。
2、病原體問題：雞糞中可以檢出芽胞桿菌屬、大腸桿菌以及十多個屬的真菌和一些寄生蟲等，但通過恰當的加工(如青貯、發酵)就可以把這些病原體全部殺滅。
3、藥物問題：大多數研究表明肉仔雞飼料中添加的藥物可以從糞便中排出，有試驗證明，若牛在屠宰前5天停喂雞糞飼料，在肌肉、肝、腎臟等中均未發現殘留藥物。因此短期停喂雞糞飼料就不會有嚴重的藥物殘留。
4、重金屬殘留：肉雞中常用有機砷作飼料添加劑促進生長，這使雞糞中的砷的含量升高，也使采食雞糞飼料的牛羊肝臟中的砷的含量升高，但這個含量低于允許的水平。至于鉛、汞、鎘等均未發現有升高情況。因此，用雞糞喂牛羊基本上沒有重金屬在組織中的殘留問題。
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