(2)施肥制度的確定。作底肥的肥料在整地前施入，追肥則按照不同作物確定其次數和數量。實施微灌施肥技術可使肥料利用率提高40%-50%，故微灌施肥的用肥量為常規施肥的50%-60%。
(3)肥料的選擇。微灌施肥系統施用底肥與傳統施肥相同，可包括多種有機肥和多種化肥。但微灌追肥的肥料品種必須是可溶性肥料。
實施水肥一體化技術要配套應用作物良種、病蟲害防治和田間管理技術。
還可因作物制宜，采用地膜覆蓋技術，形成膜下滴灌等形式，充分發揮節水節肥優勢，達到提高作物產量、改善作物品質，增加效益的目的。
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