最后，煙葉收獲完后，及時銷毀根和莖，減少翌年病毒的來源。
對普通花葉病目前還沒有特效藥可治，所以采用抗耐病品種，培育抗病優質品種對防治普通花葉病就特別重要。目前推廣的抗耐病品種有g80、nc89、柯克176等。
播種前5天必須用三嗪、二氧化氯消毒劑對舊漂盤、漂浮池、拱架、剪葉的剪刀等育苗工具進行噴霧、浸泡消毒，清洗干凈后方可投入使用。在裝盤、操作過程中，基質和漂浮盤不能接觸土壤等可能帶菌和帶毒物質。
苗床間苗、剪葉、移栽和大田管理應在露水干后進行，操作前工作人員的手和工具要用肥皂水洗2~3遍，并嚴禁吸煙。大田管理時應先管理健康的煙株。后管理有病的煙株，防治人為傳播。
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