烤煙種子細小，播種量相對較多，出苗比較密。“拉十字”期后幼苗逐漸生長，相互擁擠，有礙生長發育。間苗過晚容易出現拔脖現象，應早間苗。具體做法：“拉十字”時拔一次大草，疏開簇子苗，以后隨煙苗生長，進行間苗2-3次。問苗時要用肥皂水洗手，不要在床內吸煙，以防花葉病的傳染。

稀留苗是指與留苗普遍偏密相對而盲的。現在不少地方留苗過密，苗距不足3-4厘米，煙苗大小不一，移栽到大田后生長很不整齊。根據生產實踐，留苗距離5-7厘米為好。煙苗根系發達，葉面積大，根重增加。

苗床經常澆水，床土容易板結，不利于煙苗生長。中耕松土能使床土表面疏松，增加通透性，加速肥料分解。特別是深中耕，能促進根系發育，多發側根和須根，擴大幼苗吸收養分的能力，拔苗時易帶土垛，移栽后成活率高。

一般中耕可進行2-3次。第一次結合定苗進行中耕，深度2-3厘米；第二次于第一次之后6-7天進行，可采取小苗“搬家”的方法，即移動整個煙苗，或用鑷子沿煙苗四周深耕，斷其主根及側根，以利多發須根。中耕要結合施肥，促進煙苗生長。