1癥狀類似

新城疫的神經癥狀、產蛋下降與很多疫病類似，常常是造成與其他疫病誤診的主要原因，包括禽流感、傳染性支氣管炎、減蛋綜合征等。

(1)呼吸道癥狀類似：包括禽流感、傳染性支氣管炎、傳染性喉氣管炎等。與傳染性支氣管炎的區別在于，傳染性支氣管炎不會出現神經癥狀；與傳染性喉氣管炎的區別在于，雞新城疫不會出現咯血現象；與禽流感的區別在于，雞新城疫不會出現腫頭、腿部鱗片出血等癥狀。

(2)神經癥狀類似：這種類型的雞新城疫主要與禽流感難以區別，應進行實驗室鑒別診斷。

(3)產蛋下降類似：這種類型的雞新城疫主要與禽流感、傳染性支氣管炎、傳染性喉氣管炎、傳染性鼻炎和減蛋綜合征等疫病難以區別，應進行實驗室鑒別診斷。

2剖檢變化類似

腺胃出血、腸道“島嶼狀”出血及潰瘍常常是新城疫典型的病理變化，能產生這類病變的還包括禽流感、傳染性腺胃炎和毒素中毒等。這些病都能引起腺胃出血，但禽流感同時可以引起腸道“島嶼狀”出血和潰瘍、腎腫、脂肪出血等病變；傳染性腺胃炎沒有腸道“島嶼狀”出血及潰瘍的病變，還能出現腺胃腫、腎腫等病變；毒寨中毒會出現肺臟、腎臟的出血和肝臟病變。

3免疫失敗

理論上講，新城疫的預防接種所產生的免疫力足以抵抗病毒的感染，但新城疫的免疫保護水平受母源抗體水平、疫苗種類、弱毒疫苗株的性質、免疫程序等因素的影響，疫苗接種雞群存在低免個體，仍然存在病毒的感染的可能。另外，城疫的免疫保護水平是相對的。實踐證明，同樣的新城疫的免疫水平，隔離措施較好，環境清潔的雞群，不發生新城疫；而相對開放飼養的雞群經常，同樣可以發新城疫。因此，決不能以預防接種來代替良好的管理和安全措施。