2、改善品質
施用微生物菌劑的農產品，蛋白質、糖分、維生素、氨基酸等有益成份含量明顯提高，籽粒、果實豐滿光滑，蔬菜果品色澤亮麗，既好吃又好看，價值還高。
3、提高化肥利用率
微生物菌劑有效菌大多能分解土壤中有機質，有機質分解過程中生成腐殖酸，腐殖酸與土壤中的氮形成腐殖酸銨，可減少氮肥的流失，提高鉀、磷元素利用率，降低生產投入，減少資源浪費。
4、改善土壤養分
微生物菌劑有效菌所分泌胞外多糖物質，是土壤團粒結構的粘合劑，能夠增強土壤團粒結構，疏松土壤，提高土壤通透性和保水保肥能力，增加土壤有機質，活化土壤中的潛在養分，改善土壤中養分的供應狀況。
五、使用微生物菌劑的注意事項
1、避免高溫干旱或雨天施用微生物菌劑，會影響有益菌的活性。
2、嚴禁將微生物菌劑和除草劑、殺蟲劑以及殺菌劑等農藥一起使用，如果一起施用了不僅會降低有益菌的活性，甚至還會將其殺死。
3、在果樹種植中，微生物肥料不僅能當作基肥，還能作追肥使用。
