復混肥料的配方雖然是針對作物對養分的需求、土壤供肥特點確定的，但很難完全符合實際需求，因此在施用復混肥料時，還應根據田間作物的生長情況用單質肥料調節營養元素的比例，使之最終適合作物營養的要求是非常必要的。
復混肥料有磷或磷鉀成分，同時大都呈顆粒狀，比粉狀單元化肥溶解緩慢，因此，一般用作基肥，亦可用作種肥和追肥。
①基肥又稱底肥，是整地、翻耕時施用的肥料。施用復混肥料，可以滿足作物苗期對多種養分的需求，有利于壯苗，所以基肥充足是獲得作物高產的基礎。基肥的用量與作物種類、土壤性質等關系密切。
②種肥是指播種或移栽時施用的肥料。使用復混肥作種肥時，一般不宜隨種下肥，同時也應避免肥料與幼苗的直接接觸，在土壤中肥料顆粒應與種子或幼苗保持一定的距離。
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