西瓜常見的畸形瓜有頭大、一頭小的葫蘆彤瓜，縱徑比橫徑小的扁平瓜以及果實兩邊發育不均，偏向一邊生長的甭瓜（又叫偏頭瓜）。

(1)葫蘆形瓜。葫蘆彤瓜產生的原因，一是授粉質量低，授粉量不足、不均勻，瓜的前端種子多，基部種子少，營養供應不均勻導致前、后部的膨大速度不勻而造成的；二是結瓜初期溫度偏低或土壤干旱缺水，幼瓜生長緩慢，而結瓜中后期又遇高溫、高濕條件，西瓜膨大較快，從而形成了前大后小的葫蘆形瓜：

防止葫蘆形瓜，一要進行人工輔助授粉，加大授粉量，并要提高授粉質量；二要保證肥水均勻供應，防止忽多忽少；三要防止結瓜初期溫度偏低。

(2)扁平瓜。扁平瓜產生的原因，是結瓜前期的溫度偏低，瓜的縱向生長（也即伸長生長）受到抑制所致。因為西瓜坐瓜后首先是進行縱向生長，然后進行橫向生長，當前期溫度低時，縱向生長速度慢，生長沒有達到應有的量，但西瓜生長后期溫度正常或偏高時，橫向生長速度快出現扁平瓜。

防止形成扁平瓜，一是要合理安排結瓜期，把結瓜期放到溫度適宜的范圍內；二要加強低溫期的增溫和保溫措施，保持棚溫15℃以上；三要加強肥水管理和病蟲的防治工作，保護好瓜秧；四要選中節位的瓜留瓜，不要選第一雌花的瓜留瓜。

(3)歪瓜。歪瓜產生的原因有以下幾個：①授粉不良。授粉量不足或授粉不均勻時，瓜內的種子容易集中分布于瓜的一側。通常，瓜內種子多的一側，營養供應也較多，生長速度快，外部表現為膨大迅速；而種子少的一側，則因營養供應不足，膨大較慢，從而導致瓜的兩側膨大不均勻，形成歪瓜。②瓜面溫度分布不均。一般講，瓜的朝陽面溫度較高，膨大也較快，而瓜的貼地面一側，則因溫度較低，膨大較慢，從而形成了上大下小的歪瓜。③機械損傷。瓜在膨大過程中，局部瓜面受到機械損傷時，受損傷的一面多生長緩慢，從而形成歪瓜。④營養不良。瓜秧生長勢弱或遭受病蟲危害或小秧結瓜時，會因瓜秧的有效葉面積小，瓜的營養供應不足，而形成歪瓜。